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根据院主席团会议审议通过的《中国工程院2006—2010年度工作纲要》，结合院党组提出的要加强开拓性的要求，2009年的工作要点如下：
一、做好院士增选工作，加强院士队伍建设
认真总结和借鉴多年来院士增选工作的经验，继续改进和完善增选过程中各个环节的工作，坚持宁缺毋滥的原则，严格掌握院士的标准和条件，严肃增选全过程的纪律，加强社会监督，并注意选拔年轻的优秀人才，保证新当选院士的质量。
继续动态跟踪院士队伍结构和我国高层次工程科技人才结构的变化，实行总量控制、适度微调的方针，保持院士队伍的适度规模，优化结构，实现院士队伍高质量、可持续的发展。大力宣传院士典型事迹，倡导无私奉献的高尚品德和创新精神。弘扬科学精神，传播科学知识，坚决抵制一切违反科学道德的行为。
二、积极推进国家工程科技思想库的建设
学习实践科学发展观，研究落实院党组提出的各项整改措施，并遵照胡锦涛总书记关于建设国家科学技术思想库的战略构思，以科学发展观为指导，以服务于国家经济社会发展、保障国家安全为目的，以促进工程科技健康发展、提高自主创新能力、建设创新型国家为核心，积极探索建设工程科技思想库的方法、途径、体制和机制，抓紧从组织上尽快落实国家工程科技思想库建设的各项工作。
三、积极应对金融危机，开展战略咨询
国际金融危机对于我国来说，既是严峻的挑战，也是极好的发展和超越机遇。如何抓住机遇，迎接挑战，是一个需要时刻关注并深入研究的重大战略问题。2009年，工程院将在继续推进战略咨询研究工作的基础上，积极组织院士、专家，发挥院士跨学科、跨部门的群体优势，联合科学界开展相应的对策研究，并根据项目研究工作进展，及时提出相应的对策和建议，向党中央、国务院建言献策。
四、做好“工程科技中长期发展战略研究”
组织有关院士、专家，开展我国工程科技中长期发展战略研究重大咨询项目。通过调研和多学科交叉的研讨与分析，查明我国工程科技各个专业技术领域（涉及工程院9个学部、几十个专业领域，包括部分基础研究，重点突出应用研究领域）的发展现状、发展趋势，研发中存在的突出问题，以及与国际领先水平的差距，同时结合国家经济、社会发展的需要，提出各专业技术领域的阶段性（近期、中期和长期）研发目标、重点、难点和相应的技术路线图，以及建议国家给予重点支持的研发项目名录和对策建议等，对全面提升我国工程科技水平和核心竞争力具有重要的战略意义。
五、加快咨询服务中心建设
中国工程院咨询服务中心已获国家批准。2009年要加快推进咨询中心建设，并将咨询中心纳入国家工程科技思想库建设体系，认真做好顶层设计，并在顶层设计框架的基础上，做好咨询中心的组建工作。
六、加强院地合作、院部合作
加强院地合作、院部合作，既是地方和有关部委的需要，也是国家经济建设和工程科技发展的需要，对此应给予高度重视。院地合作要在认真总结以前经验的基础上，坚持抓重点、讲实效、量力而行的原则，逐步稳健推进。同时根据已经签署的合作协议，进一步落实与工业与信息化部等单位的合作事宜。
七、积极推进院士行活动
技术创新院士行活动是我院与国家发改委联合组织的具有特色的咨询活动，通过多年的实践，取得良好的效果。2009年在与国家发改委联合组织好院士行活动的基础上，进一步总结经验，探索与工业与信息化部联合组织相关的院士行活动，以帮助企业应对金融危机、提高技术创新能力，促进经济的平稳发展。
八、进一步活跃学术交流
篮球比分是工程院的重要活动之一。组织好篮球比分对提高科技水平、促进科技创新具有重要而深远的意义。2009年积极开展学术交流活动，继续有针对性地结合工程科技发展的前沿问题和重点领域发展趋势，举办香山科学会议、工程科技论坛等各类篮球比分，并与中国科协、中国科学院组织相关的篮球比分。
九、继续加强国际合作与交流
拓展国际交流渠道，推动实质性合作。继续加强与各国工程科技组织的联系与交流；认真落实已有的与瑞典皇家工程科学院的“可再生能源与环境”合作项目，加强人员交流和扩展长期人员培训，并争取项目实现延续进行；办好“中美工程前沿研讨会”、“中澳中小企业技术创新与转化研讨会”等活动。
2009年工程院还要认真完成党中央、国务院交办的其他各项任务。加强党的建设和机关建设，做好宣传、出版和奖励工作。进一步加强与国务院新闻办公室的联系，保持与各新闻媒体的畅通渠道。向社会广为宣传工程科技在经济社会发展中的重要作用，宣传院士为国家科技进步做出的突出贡献。提高《中国工程科学》杂志及其英文版的质量，办好《工程前沿》和《院士通讯》等出版物。
在新的一年里，工程院将在党中央、国务院的直接领导下，同全国广大科技工作者一道，积极应对金融危机，为推动我国工程科技的自主创新和发展，为祖国的繁荣昌盛，做出新的贡献！
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